En el territorio del Municipio de Francisco Pizarro, el soporte de la economía gira en torno a las actividades generadas por la explotación de los recursos naturales, que se aprovecha a través de una economía tradicional.
El trabajo de madera se realiza en grupo, en la mayoría de los casos bajo el mando y el pago de jornal por parte del dueño de la zanja, otras veces se trabaja en sociedad de parientes, o amigos del sector. El transporte de la madera de los guandales hasta el río es pesado y difícil y complicado. En primer lugar depende de procesos de la naturaleza, de la lluvia que alimenta el río para que la madera pueda bajar sin muchas dificultades y no se vaya a podrir en terreno seco. Igualmente la actividad económica se ve complementada con la pesca, la tala de los árboles, el conchero y la explotación de otras especies acuícola que en un porcentaje muy alto son utilizadas para el consumo familiar.
El resto de la producción, se vincula a la economía regional, a través del intercambio de excedentes. Los procesos productivos en la zona, son desarticulados, por la presencia de una gran cantidad de intermediarios, los cuales obtienen la mayor cantidad del valor agregado de los recursos naturales que se extraen.
Pero es importante resaltar que ante las múltiples dificultades socioeconómicas reinantes en la zona, esta región tiene ventajas comparativas por su biodiversidad, su posición geográfica, riqueza de los suelos y abundancia del recurso hídrico.
No obstante, la economía del municipio, sigue siendo extractiva en torno a la explotación de madera, minería, y pesca; en las zonas de colonización cobra importancia la ganadería, en donde los campesinos combinan las actividades extractivas con la agropecuaria con fines netamente de comercialización.
Esta investigación considera importante realizar un análisis del precio de la madera el cual esta sujeto a la conveniencia del comprador. El precio de la madera en bruto es muy bajo y a duras penas cubre la mano de obra.
La madera es la materia prima, que en la zona tiene unos valores relativamente bajos, causados por pos precios del mayorista. La explotación que desde los años sesenta realizó Chapas y Maderas de Nariño, quienes al final y después de realizar explotaciones de enclave o sea con beneficio mayoritario para la empresa explotadora y no para la región, sumieron a Francisco Pizarro en un municipio sin posibilidades de generar riqueza a través de la explotación forestal, pues la misma fue arrasada por esta compañía, por lo que la opción que el cortero tiene es de esperar a la regeneración del bosque, con el fin de generar procesos de explotación adecuados hacia el futuro.
En el Municipio de Francisco Pizarro, no precisamente la actividad agrícola es la de mayor importancia, en la cual las familias de la zona rural derivan su sustento de esta actividad. La actividad pesquera es prácticamente la base de la economía, su práctica es tradicional donde la captura de las diferentes especies una vez comercializadas solo alcanza para el sustento diario. Esta investigación, considera que el 50% de la población se dedica a esta labor; un 10% de la población se dedica a la extracción de la concha, productos que se comercializan con el vecino país del Ecuador. Se resalta el hecho de que en estas actividades el intermediario es el de mayor beneficio.
Los productos agropecuarios que se cultivan en la zona como: Plátano, Arroz, Cítricos, Cacao, Mamey, Borojó, son cultivos tradicionales y de pan coger, sin embargo, los campesinos en búsqueda de obtener mayor rentabilidad, han diversificado la producción con productos como: Caña de Azúcar, Yuca, y Arroz mejor tecnificado.
Es conocido por los habitantes del sector, que el transporte para la comercialización de estos productos en difícil, debido a la escasez de transporte fluvial y a la sedimenación del Río Patía
